Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSTAP01040 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSTAP01040 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSTAP01040 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTAP01040 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSTAP01040 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSTAP01040 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSTAP01040 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTAP01040 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTAP01040 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTAP01040 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTAP01040 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSTAP01040 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSTAP01040 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSTAP01040 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTAP01040 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTAP01040 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTAP01040 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTAP01040 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTAP01040 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTAP01040 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTAP01040 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTAP01040 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTAP01040 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTAP01040 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSTAP01040 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSTAP01040 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTAP01040 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTAP01040 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTAP01040 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTAP01040 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTAP01040 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTAP01040 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTAP01040 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTAP01040 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTAP01040 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTAP01040 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTAP01040 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTAP01040 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTAP01040 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSTAP01040 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTAP01040 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTAP01040 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTAP01040 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTAP01040 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTAP01040 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTAP01040 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTAP01040 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTAP01040 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTAP01040 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTAP01040 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTAP01040 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTAP01040 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTAP01040 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTAP01040 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSTAP01040 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSTAP01040 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSTAP01040 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSTAP01040 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTAP01040 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTAP01040 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTAP01040 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTAP01040 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTAP01040 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTAP01040 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTAP01040 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTAP01040 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTAP01040 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTAP01040 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTAP01040 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTAP01040 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTAP01040 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTAP01040 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSTAP01040 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTAP01040 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTAP01040 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTAP01040 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTAP01040 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTAP01040 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTAP01040 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTAP01040 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTAP01040 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTAP01040 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTAP01040 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTAP01040 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTAP01040 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTAP01040 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTAP01040 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTAP01040 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTAP01040 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTAP01040 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTAP01040 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTAP01040 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTAP01040 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTAP01040 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTAP01040 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTAP01040 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTAP01040 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTAP01040 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTAP01040 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms