Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D2O95562 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D2O95562 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D2O95562 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D2O95562 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFT2D2O95562 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFT2D2O95562 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D2O95562 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFT2D2O95562 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D2O95562 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D2O95562 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D2O95562 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms