Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAPLNO95428 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAPLNO95428 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPLNO95428 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PAPLNO95428 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAPLNO95428 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPLNO95428 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PAPLNO95428 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAPLNO95428 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAPLNO95428 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPLNO95428 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 505.9 ms