Protein–RNA interactions for Protein: O95394

PGM3, Phosphoacetylglucosamine mutase, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM3O95394 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGM3O95394 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGM3O95394 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGM3O95394 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM3O95394 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM3O95394 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM3O95394 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGM3O95394 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGM3O95394 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGM3O95394 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGM3O95394 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGM3O95394 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGM3O95394 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGM3O95394 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGM3O95394 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGM3O95394 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM3O95394 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM3O95394 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM3O95394 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM3O95394 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM3O95394 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGM3O95394 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGM3O95394 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGM3O95394 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGM3O95394 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGM3O95394 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGM3O95394 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGM3O95394 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGM3O95394 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGM3O95394 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGM3O95394 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGM3O95394 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGM3O95394 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGM3O95394 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PGM3O95394 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PGM3O95394 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGM3O95394 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGM3O95394 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGM3O95394 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGM3O95394 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGM3O95394 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGM3O95394 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGM3O95394 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGM3O95394 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGM3O95394 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGM3O95394 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGM3O95394 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGM3O95394 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGM3O95394 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGM3O95394 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGM3O95394 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGM3O95394 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGM3O95394 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGM3O95394 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGM3O95394 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGM3O95394 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGM3O95394 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGM3O95394 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGM3O95394 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGM3O95394 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGM3O95394 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGM3O95394 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGM3O95394 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGM3O95394 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGM3O95394 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGM3O95394 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGM3O95394 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGM3O95394 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PGM3O95394 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGM3O95394 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PGM3O95394 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGM3O95394 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGM3O95394 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM3O95394 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM3O95394 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM3O95394 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM3O95394 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM3O95394 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM3O95394 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM3O95394 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM3O95394 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM3O95394 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGM3O95394 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGM3O95394 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGM3O95394 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGM3O95394 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM3O95394 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM3O95394 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM3O95394 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM3O95394 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PGM3O95394 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGM3O95394 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGM3O95394 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGM3O95394 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM3O95394 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM3O95394 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM3O95394 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM3O95394 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM3O95394 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM3O95394 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms