Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOXO94900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOXO94900 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOXO94900 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOXO94900 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOXO94900 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOXO94900 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOXO94900 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOXO94900 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOXO94900 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOXO94900 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOXO94900 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOXO94900 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOXO94900 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOXO94900 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOXO94900 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOXO94900 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOXO94900 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOXO94900 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOXO94900 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOXO94900 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOXO94900 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOXO94900 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOXO94900 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOXO94900 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOXO94900 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOXO94900 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOXO94900 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOXO94900 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOXO94900 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOXO94900 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOXO94900 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOXO94900 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOXO94900 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOXO94900 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOXO94900 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOXO94900 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOXO94900 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOXO94900 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOXO94900 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOXO94900 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOXO94900 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOXO94900 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOXO94900 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOXO94900 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOXO94900 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOXO94900 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOXO94900 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOXO94900 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOXO94900 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOXO94900 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOXO94900 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOXO94900 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOXO94900 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOXO94900 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOXO94900 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOXO94900 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOXO94900 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOXO94900 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOXO94900 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOXO94900 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOXO94900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOXO94900 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOXO94900 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOXO94900 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOXO94900 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOXO94900 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOXO94900 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOXO94900 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOXO94900 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOXO94900 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOXO94900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOXO94900 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOXO94900 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOXO94900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOXO94900 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOXO94900 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOXO94900 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOXO94900 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOXO94900 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOXO94900 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOXO94900 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOXO94900 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOXO94900 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOXO94900 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOXO94900 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOXO94900 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOXO94900 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOXO94900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOXO94900 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOXO94900 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOXO94900 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOXO94900 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOXO94900 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOXO94900 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOXO94900 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOXO94900 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOXO94900 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOXO94900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOXO94900 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms