Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN9O75954 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN9O75954 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN9O75954 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN9O75954 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN9O75954 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN9O75954 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN9O75954 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms