Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTP4A3O75365 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTP4A3O75365 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A3O75365 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A3O75365 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTP4A3O75365 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A3O75365 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A3O75365 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTP4A3O75365 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A3O75365 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A3O75365 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A3O75365 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A3O75365 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A3O75365 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A3O75365 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTP4A3O75365 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A3O75365 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A3O75365 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A3O75365 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTP4A3O75365 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A3O75365 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A3O75365 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms