Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
COBLO75128 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
COBLO75128 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
COBLO75128 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
COBLO75128 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
COBLO75128 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COBLO75128 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
COBLO75128 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COBLO75128 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
COBLO75128 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COBLO75128 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
COBLO75128 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
COBLO75128 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
COBLO75128 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
COBLO75128 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COBLO75128 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
COBLO75128 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
COBLO75128 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COBLO75128 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COBLO75128 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
COBLO75128 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COBLO75128 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COBLO75128 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
COBLO75128 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
COBLO75128 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COBLO75128 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COBLO75128 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
COBLO75128 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COBLO75128 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COBLO75128 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COBLO75128 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
COBLO75128 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
COBLO75128 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
COBLO75128 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COBLO75128 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COBLO75128 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
COBLO75128 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COBLO75128 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COBLO75128 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
COBLO75128 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
COBLO75128 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
COBLO75128 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
COBLO75128 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COBLO75128 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COBLO75128 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
COBLO75128 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
COBLO75128 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
COBLO75128 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
COBLO75128 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COBLO75128 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COBLO75128 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COBLO75128 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COBLO75128 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
COBLO75128 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
COBLO75128 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COBLO75128 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COBLO75128 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COBLO75128 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COBLO75128 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
COBLO75128 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COBLO75128 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COBLO75128 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
COBLO75128 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COBLO75128 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
COBLO75128 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COBLO75128 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COBLO75128 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COBLO75128 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
COBLO75128 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COBLO75128 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COBLO75128 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
COBLO75128 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
COBLO75128 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
COBLO75128 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COBLO75128 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COBLO75128 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
COBLO75128 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COBLO75128 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
COBLO75128 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
COBLO75128 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COBLO75128 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COBLO75128 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
COBLO75128 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
COBLO75128 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COBLO75128 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
COBLO75128 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
COBLO75128 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
COBLO75128 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
COBLO75128 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COBLO75128 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COBLO75128 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COBLO75128 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
COBLO75128 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
COBLO75128 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
COBLO75128 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
COBLO75128 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COBLO75128 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
COBLO75128 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COBLO75128 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COBLO75128 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.4 ms