Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNCRIPO60506 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNCRIPO60506 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNCRIPO60506 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNCRIPO60506 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNCRIPO60506 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNCRIPO60506 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNCRIPO60506 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNCRIPO60506 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNCRIPO60506 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNCRIPO60506 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNCRIPO60506 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNCRIPO60506 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms