Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PLXNC1O60486 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PLXNC1O60486 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PLXNC1O60486 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PLXNC1O60486 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PLXNC1O60486 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PLXNC1O60486 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PLXNC1O60486 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PLXNC1O60486 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PLXNC1O60486 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PLXNC1O60486 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
PLXNC1O60486 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PLXNC1O60486 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
PLXNC1O60486 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PLXNC1O60486 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PLXNC1O60486 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PLXNC1O60486 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PLXNC1O60486 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PLXNC1O60486 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PLXNC1O60486 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PLXNC1O60486 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PLXNC1O60486 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PLXNC1O60486 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PLXNC1O60486 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PLXNC1O60486 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PLXNC1O60486 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PLXNC1O60486 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PLXNC1O60486 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PLXNC1O60486 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PLXNC1O60486 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
PLXNC1O60486 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PLXNC1O60486 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PLXNC1O60486 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PLXNC1O60486 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PLXNC1O60486 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PLXNC1O60486 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PLXNC1O60486 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PLXNC1O60486 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PLXNC1O60486 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PLXNC1O60486 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PLXNC1O60486 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PLXNC1O60486 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.15
PLXNC1O60486 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PLXNC1O60486 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PLXNC1O60486 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PLXNC1O60486 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PLXNC1O60486 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
PLXNC1O60486 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PLXNC1O60486 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PLXNC1O60486 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PLXNC1O60486 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PLXNC1O60486 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
PLXNC1O60486 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PLXNC1O60486 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PLXNC1O60486 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
PLXNC1O60486 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PLXNC1O60486 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
PLXNC1O60486 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PLXNC1O60486 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PLXNC1O60486 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PLXNC1O60486 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PLXNC1O60486 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PLXNC1O60486 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
PLXNC1O60486 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PLXNC1O60486 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms