Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP9BO43861 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP9BO43861 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9BO43861 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP9BO43861 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP9BO43861 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9BO43861 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP9BO43861 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP9BO43861 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP9BO43861 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP9BO43861 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP9BO43861 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP9BO43861 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP9BO43861 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP9BO43861 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP9BO43861 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP9BO43861 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP9BO43861 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP9BO43861 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP9BO43861 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP9BO43861 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP9BO43861 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms