Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AKAP8O43823 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AKAP8O43823 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP8O43823 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP8O43823 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AKAP8O43823 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AKAP8O43823 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AKAP8O43823 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AKAP8O43823 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AKAP8O43823 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AKAP8O43823 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AKAP8O43823 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AKAP8O43823 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms