Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EPB41L2O43491 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EPB41L2O43491 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EPB41L2O43491 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EPB41L2O43491 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EPB41L2O43491 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EPB41L2O43491 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EPB41L2O43491 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EPB41L2O43491 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EPB41L2O43491 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EPB41L2O43491 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EPB41L2O43491 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EPB41L2O43491 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
EPB41L2O43491 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
EPB41L2O43491 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EPB41L2O43491 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EPB41L2O43491 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L2O43491 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EPB41L2O43491 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms