Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNL1O43396 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNL1O43396 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNL1O43396 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TXNL1O43396 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNL1O43396 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms