Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIMBP2O15034 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP2O15034 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMBP2O15034 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP2O15034 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP2O15034 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMBP2O15034 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMBP2O15034 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP2O15034 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIMBP2O15034 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP2O15034 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP2O15034 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RIMBP2O15034 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RIMBP2O15034 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RIMBP2O15034 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RIMBP2O15034 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RIMBP2O15034 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RIMBP2O15034 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RIMBP2O15034 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RIMBP2O15034 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RIMBP2O15034 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RIMBP2O15034 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RIMBP2O15034 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RIMBP2O15034 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RIMBP2O15034 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms