Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCANO14594 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCANO14594 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCANO14594 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCANO14594 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCANO14594 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NCANO14594 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCANO14594 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCANO14594 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCANO14594 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCANO14594 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCANO14594 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCANO14594 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCANO14594 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NCANO14594 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCANO14594 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NCANO14594 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCANO14594 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCANO14594 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCANO14594 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCANO14594 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCANO14594 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCANO14594 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCANO14594 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCANO14594 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCANO14594 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCANO14594 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCANO14594 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCANO14594 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCANO14594 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCANO14594 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCANO14594 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCANO14594 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCANO14594 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCANO14594 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCANO14594 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCANO14594 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCANO14594 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCANO14594 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCANO14594 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCANO14594 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NCANO14594 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCANO14594 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCANO14594 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCANO14594 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCANO14594 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NCANO14594 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCANO14594 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCANO14594 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCANO14594 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCANO14594 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCANO14594 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCANO14594 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCANO14594 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NCANO14594 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCANO14594 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCANO14594 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCANO14594 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCANO14594 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCANO14594 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCANO14594 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCANO14594 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCANO14594 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCANO14594 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCANO14594 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCANO14594 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NCANO14594 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCANO14594 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCANO14594 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCANO14594 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCANO14594 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCANO14594 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCANO14594 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCANO14594 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCANO14594 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCANO14594 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCANO14594 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCANO14594 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCANO14594 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCANO14594 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCANO14594 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCANO14594 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCANO14594 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCANO14594 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCANO14594 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCANO14594 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCANO14594 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NCANO14594 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NCANO14594 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCANO14594 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCANO14594 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCANO14594 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCANO14594 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCANO14594 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NCANO14594 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCANO14594 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCANO14594 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCANO14594 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCANO14594 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCANO14594 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms