Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEMP1O14524 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMP1O14524 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEMP1O14524 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEMP1O14524 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEMP1O14524 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEMP1O14524 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEMP1O14524 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEMP1O14524 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEMP1O14524 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEMP1O14524 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEMP1O14524 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEMP1O14524 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEMP1O14524 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEMP1O14524 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEMP1O14524 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEMP1O14524 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEMP1O14524 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEMP1O14524 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMP1O14524 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEMP1O14524 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEMP1O14524 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP1O14524 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEMP1O14524 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.9 ms