Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF103O00237 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF103O00237 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF103O00237 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF103O00237 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF103O00237 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF103O00237 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF103O00237 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF103O00237 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF103O00237 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF103O00237 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF103O00237 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF103O00237 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF103O00237 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF103O00237 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF103O00237 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF103O00237 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF103O00237 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF103O00237 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF103O00237 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF103O00237 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF103O00237 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF103O00237 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF103O00237 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF103O00237 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF103O00237 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF103O00237 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF103O00237 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF103O00237 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF103O00237 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF103O00237 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF103O00237 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF103O00237 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF103O00237 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF103O00237 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF103O00237 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF103O00237 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF103O00237 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF103O00237 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF103O00237 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF103O00237 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF103O00237 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF103O00237 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF103O00237 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF103O00237 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF103O00237 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF103O00237 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF103O00237 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF103O00237 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF103O00237 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF103O00237 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF103O00237 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF103O00237 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF103O00237 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF103O00237 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF103O00237 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF103O00237 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF103O00237 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF103O00237 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF103O00237 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF103O00237 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF103O00237 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF103O00237 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF103O00237 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF103O00237 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF103O00237 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF103O00237 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF103O00237 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF103O00237 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF103O00237 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF103O00237 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF103O00237 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF103O00237 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF103O00237 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF103O00237 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF103O00237 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF103O00237 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF103O00237 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF103O00237 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF103O00237 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF103O00237 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF103O00237 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF103O00237 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF103O00237 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF103O00237 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF103O00237 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF103O00237 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF103O00237 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF103O00237 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF103O00237 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF103O00237 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RNF103O00237 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF103O00237 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF103O00237 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF103O00237 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF103O00237 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF103O00237 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNF103O00237 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF103O00237 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF103O00237 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms