Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms