Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRN3E7EW58 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRN3E7EW58 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRN3E7EW58 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRN3E7EW58 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3E7EW58 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3E7EW58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRN3E7EW58 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRN3E7EW58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRN3E7EW58 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRN3E7EW58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN3E7EW58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN3E7EW58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN3E7EW58 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRN3E7EW58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRN3E7EW58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRN3E7EW58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRN3E7EW58 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN3E7EW58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3E7EW58 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms