Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E5RI56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E5RI56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E5RI56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E5RI56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E5RI56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E5RI56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E5RI56 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E5RI56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E5RI56 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E5RI56 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E5RI56 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E5RI56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
E5RI56 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
E5RI56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E5RI56 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E5RI56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E5RI56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E5RI56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E5RI56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E5RI56 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E5RI56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E5RI56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E5RI56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
E5RI56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E5RI56 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E5RI56 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E5RI56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E5RI56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E5RI56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E5RI56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E5RI56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E5RI56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
E5RI56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E5RI56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E5RI56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E5RI56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E5RI56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E5RI56 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E5RI56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E5RI56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E5RI56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E5RI56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E5RI56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E5RI56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E5RI56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
E5RI56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E5RI56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
E5RI56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E5RI56 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E5RI56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E5RI56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E5RI56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E5RI56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E5RI56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E5RI56 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E5RI56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E5RI56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E5RI56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E5RI56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E5RI56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E5RI56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E5RI56 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E5RI56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E5RI56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E5RI56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E5RI56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E5RI56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E5RI56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E5RI56 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E5RI56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E5RI56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E5RI56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E5RI56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E5RI56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E5RI56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E5RI56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E5RI56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E5RI56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E5RI56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E5RI56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E5RI56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
E5RI56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E5RI56 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E5RI56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E5RI56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E5RI56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E5RI56 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E5RI56 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E5RI56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E5RI56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E5RI56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
E5RI56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E5RI56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E5RI56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E5RI56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E5RI56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E5RI56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E5RI56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E5RI56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms