Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UPK3BL1B0FP48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UPK3BL1B0FP48 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPK3BL1B0FP48 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPK3BL1B0FP48 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPK3BL1B0FP48 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPK3BL1B0FP48 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPK3BL1B0FP48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPK3BL1B0FP48 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms