Protein–RNA interactions for Protein: A6NL88

SHISA7, Protein shisa-7, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA7A6NL88 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA7A6NL88 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA7A6NL88 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA7A6NL88 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHISA7A6NL88 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHISA7A6NL88 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHISA7A6NL88 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA7A6NL88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA7A6NL88 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA7A6NL88 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA7A6NL88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA7A6NL88 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHISA7A6NL88 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHISA7A6NL88 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHISA7A6NL88 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA7A6NL88 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHISA7A6NL88 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA7A6NL88 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SHISA7A6NL88 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA7A6NL88 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA7A6NL88 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA7A6NL88 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHISA7A6NL88 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHISA7A6NL88 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms