Protein–RNA interactions for Protein: A6NI28

ARHGAP42, Rho GTPase-activating protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP42A6NI28 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP42A6NI28 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP42A6NI28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP42A6NI28 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP42A6NI28 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP42A6NI28 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP42A6NI28 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP42A6NI28 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP42A6NI28 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP42A6NI28 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGAP42A6NI28 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP42A6NI28 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP42A6NI28 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP42A6NI28 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP42A6NI28 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms