Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VWA3AA6NCI4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VWA3AA6NCI4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VWA3AA6NCI4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VWA3AA6NCI4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
VWA3AA6NCI4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VWA3AA6NCI4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
VWA3AA6NCI4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VWA3AA6NCI4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
VWA3AA6NCI4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
VWA3AA6NCI4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VWA3AA6NCI4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VWA3AA6NCI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VWA3AA6NCI4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
VWA3AA6NCI4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
VWA3AA6NCI4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
VWA3AA6NCI4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VWA3AA6NCI4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
VWA3AA6NCI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VWA3AA6NCI4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VWA3AA6NCI4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VWA3AA6NCI4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
VWA3AA6NCI4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms