Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PPE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PPE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms