Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 POLA1-203ENST00000480125 580 ntTSL 34.36□□□□□ -1.712e-8■■■■■ 42.2
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SF3B4Q15427 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 42.2
SF3B4Q15427 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 42.2
SF3B4Q15427 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 42.2
SF3B4Q15427 NUF2-211ENST00000531529 255 ntTSL 37□□□□□ -1.295e-18■■■■■ 42.2
SF3B4Q15427 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.225e-7■■■■■ 42.1
SF3B4Q15427 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 42.1
SF3B4Q15427 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 42.1
SF3B4Q15427 VPS51-213ENST00000533827 1078 ntTSL 315.89■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 42.1
SF3B4Q15427 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-12■■■■■ 42
SF3B4Q15427 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-12■■■■■ 42
SF3B4Q15427 METTL22-210ENST00000564107 438 ntTSL 36.63□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 42
SF3B4Q15427 RNF213-202ENST00000411702 6428 ntTSL 211.35□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 42
SF3B4Q15427 KTN1-218ENST00000554890 588 ntTSL 53.58□□□□□ -1.845e-9■■■■■ 42
SF3B4Q15427 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 33.69□□□□□ -1.825e-12■■■■■ 42
SF3B4Q15427 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 316.15■□□□□ 0.181e-22■■■■■ 41.9
SF3B4Q15427 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 41.9
SF3B4Q15427 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 41.9
SF3B4Q15427 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 41.9
SF3B4Q15427 CTSA-213ENST00000606782 582 ntTSL 312.17□□□□□ -0.467e-12■■■■■ 41.9
SF3B4Q15427 GPS2-213ENST00000573807 823 ntTSL 27.53□□□□□ -1.23e-12■■■■■ 41.9
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SF3B4Q15427 RDH13-209ENST00000587721 731 ntTSL 412.68□□□□□ -0.384e-10■■■■■ 41.9
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SF3B4Q15427 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.21e-10■■■■■ 41.9
SF3B4Q15427 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-10■■■■■ 41.9
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SF3B4Q15427 ZFYVE21-209ENST00000555501 4453 ntTSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.361e-10■■■■■ 41.9
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SF3B4Q15427 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 41.9
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SF3B4Q15427 KIAA1109-212ENST00000480651 883 ntTSL 23.52□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 41.8
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SF3B4Q15427 TIAL1-204ENST00000412524 515 ntTSL 55.43□□□□□ -1.541e-12■■■■■ 41.6
SF3B4Q15427 SMARCC2-207ENST00000549757 1062 ntTSL 54.63□□□□□ -1.671e-12■■■■■ 41.6
SF3B4Q15427 WDR45B-207ENST00000573656 654 ntTSL 23.69□□□□□ -1.821e-12■■■■■ 41.6
SF3B4Q15427 ARFGEF2-202ENST00000493140 245 ntTSL 22.07□□□□□ -2.081e-12■■■■■ 41.6
SF3B4Q15427 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 41.6
SF3B4Q15427 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 41.6
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SF3B4Q15427 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 41.5
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SF3B4Q15427 SRSF7-203ENST00000415527 1135 ntTSL 513.25□□□□□ -0.294e-9■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-203ENST00000462324 767 ntTSL 511.92□□□□□ -0.53e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-220ENST00000641570 1036 nt11.75□□□□□ -0.533e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-218ENST00000641491 986 nt11.75□□□□□ -0.533e-16■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 PHGDH-221ENST00000641573 1180 nt11.48□□□□□ -0.573e-16■■■■■ 41.5
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