RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527295.5

SIGIRR-209, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 1,867 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-209ENST00000527295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.31■■■■■ 4.84
SIGIRR-209ENST00000527295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.68■■■■□ 3.94
SIGIRR-209ENST00000527295 ABCC9O60706 1549 aa38.33■■■■□ 3.73
SIGIRR-209ENST00000527295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
SIGIRR-209ENST00000527295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.88■■■■□ 3.65
SIGIRR-209ENST00000527295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.36■■■■□ 3.57
SIGIRR-209ENST00000527295 NACADO15069 1562 aa37.17■■■■□ 3.54
SIGIRR-209ENST00000527295 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.13■■■■□ 3.53
SIGIRR-209ENST00000527295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.02■■■■□ 3.52
SIGIRR-209ENST00000527295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.73■■■■□ 3.47
SIGIRR-209ENST00000527295 SCRIBQ14160 1630 aa36.57■■■■□ 3.45
SIGIRR-209ENST00000527295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.24■■■■□ 3.39
SIGIRR-209ENST00000527295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.12■■■■□ 3.37
SIGIRR-209ENST00000527295 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.96■■■■□ 3.35
SIGIRR-209ENST00000527295 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.36■■■■□ 3.25
SIGIRR-209ENST00000527295 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.04■■■■□ 3.2
SIGIRR-209ENST00000527295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
SIGIRR-209ENST00000527295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
SIGIRR-209ENST00000527295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
SIGIRR-209ENST00000527295 SMARCA4P51532 1647 aa34.95■■■■□ 3.18
SIGIRR-209ENST00000527295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
SIGIRR-209ENST00000527295 WIZO95785 1651 aa34.71■■■■□ 3.15
SIGIRR-209ENST00000527295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.59■■■■□ 3.13
SIGIRR-209ENST00000527295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.58■■■■□ 3.13
SIGIRR-209ENST00000527295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.49■■■■□ 3.11
SIGIRR-209ENST00000527295 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.48■■■■□ 3.11
SIGIRR-209ENST00000527295 SMARCA2P51531 1590 aa34.47■■■■□ 3.11
SIGIRR-209ENST00000527295 NCAPD3P42695 1498 aa34.36■■■■□ 3.09
SIGIRR-209ENST00000527295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
SIGIRR-209ENST00000527295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SIGIRR-209ENST00000527295 HMGXB3Q12766 1538 aa34.19■■■■□ 3.06
SIGIRR-209ENST00000527295 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.99■■■■□ 3.03
SIGIRR-209ENST00000527295 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.48■■■□□ 2.95
SIGIRR-209ENST00000527295 NESP48681 1621 aa33.46■■■□□ 2.95
SIGIRR-209ENST00000527295 CFTRP13569 1480 aa33.43■■■□□ 2.94
SIGIRR-209ENST00000527295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.25■■■□□ 2.91
SIGIRR-209ENST00000527295 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.12■■■□□ 2.89
SIGIRR-209ENST00000527295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.11■■■□□ 2.89
SIGIRR-209ENST00000527295 ABCC8Q09428 1581 aa33.09■■■□□ 2.89
SIGIRR-209ENST00000527295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.07■■■□□ 2.89
SIGIRR-209ENST00000527295 PRDM2Q13029 1718 aa33.07■■■□□ 2.88
SIGIRR-209ENST00000527295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.94■■■□□ 2.86
SIGIRR-209ENST00000527295 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.93■■■□□ 2.86
SIGIRR-209ENST00000527295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.91■■■□□ 2.86
SIGIRR-209ENST00000527295 ERCC6Q03468 1493 aa32.9■■■□□ 2.86
SIGIRR-209ENST00000527295 TRIM41Q8WV44 630 aa32.9■■■□□ 2.86
SIGIRR-209ENST00000527295 SYNJ1O43426 1573 aa32.79■■■□□ 2.84
SIGIRR-209ENST00000527295 CUX1P39880 1505 aa32.79■■■□□ 2.84
SIGIRR-209ENST00000527295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
SIGIRR-209ENST00000527295 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.68■■■□□ 2.82
SIGIRR-209ENST00000527295 TOPBP1Q92547 1522 aa32.66■■■□□ 2.82
SIGIRR-209ENST00000527295 TOP2BQ02880 1626 aa32.65■■■□□ 2.82
SIGIRR-209ENST00000527295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.63■■■□□ 2.81
SIGIRR-209ENST00000527295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.6■■■□□ 2.81
SIGIRR-209ENST00000527295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
SIGIRR-209ENST00000527295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.53■■■□□ 2.8
SIGIRR-209ENST00000527295 WDR62O43379 1518 aa32.5■■■□□ 2.79
SIGIRR-209ENST00000527295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
SIGIRR-209ENST00000527295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.42■■■□□ 2.78
SIGIRR-209ENST00000527295 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
SIGIRR-209ENST00000527295 SOGA1O94964 1423 aa32.39■■■□□ 2.78
SIGIRR-209ENST00000527295 CUX2O14529 1486 aa32.32■■■□□ 2.76
SIGIRR-209ENST00000527295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.3■■■□□ 2.76
SIGIRR-209ENST00000527295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
SIGIRR-209ENST00000527295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
SIGIRR-209ENST00000527295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.18■■■□□ 2.74
SIGIRR-209ENST00000527295 IFT140Q96RY7 1462 aa32.18■■■□□ 2.74
SIGIRR-209ENST00000527295 KIF27Q86VH2 1401 aa32.12■■■□□ 2.73
SIGIRR-209ENST00000527295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
SIGIRR-209ENST00000527295 WDR97A6NE52 1622 aa32.08■■■□□ 2.73
SIGIRR-209ENST00000527295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.735e-7■■■■■ 27.5
SIGIRR-209ENST00000527295 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.05■■■□□ 2.72
SIGIRR-209ENST00000527295 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.05■■■□□ 2.72
SIGIRR-209ENST00000527295 EEA1Q15075 1411 aa32■■■□□ 2.71
SIGIRR-209ENST00000527295 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.99■■■□□ 2.71
SIGIRR-209ENST00000527295 IGF1RP08069 1367 aa31.96■■■□□ 2.71
SIGIRR-209ENST00000527295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.95■■■□□ 2.7
SIGIRR-209ENST00000527295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.93■■■□□ 2.7
SIGIRR-209ENST00000527295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
SIGIRR-209ENST00000527295 GRIN2BQ13224 1484 aa31.81■■■□□ 2.68
SIGIRR-209ENST00000527295 PBRM1Q86U86 1689 aa31.78■■■□□ 2.68
SIGIRR-209ENST00000527295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.77■■■□□ 2.68
SIGIRR-209ENST00000527295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.77■■■□□ 2.68
SIGIRR-209ENST00000527295 PRXQ9BXM0 1461 aa31.73■■■□□ 2.67
SIGIRR-209ENST00000527295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.72■■■□□ 2.67
SIGIRR-209ENST00000527295 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.7■■■□□ 2.67
SIGIRR-209ENST00000527295 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 KIF21BO75037 1637 aa31.63■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 FBLN2P98095 1184 aa31.63■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 CUL7Q14999 1698 aa31.62■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.61■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 GOLGA3Q08378 1498 aa31.6■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 ADAMTS12P58397 1594 aa31.59■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
SIGIRR-209ENST00000527295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
SIGIRR-209ENST00000527295 SYNJ2O15056 1496 aa31.49■■■□□ 2.63
SIGIRR-209ENST00000527295 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
SIGIRR-209ENST00000527295 GRIN2AQ12879 1464 aa31.42■■■□□ 2.62
SIGIRR-209ENST00000527295 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.39■■■□□ 2.62
SIGIRR-209ENST00000527295 CHD1O14646 1710 aa31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms