RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355235.7

TBC1D9B-201, Transcript of TBC1 domain family member 9B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene TBC1D9B, Length 5,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9B-201ENST00000355235 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.61■■■□□ 2.17
TBC1D9B-201ENST00000355235 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.12■■■□□ 2.09
TBC1D9B-201ENST00000355235 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9B-201ENST00000355235 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.01■■□□□ 1.91
TBC1D9B-201ENST00000355235 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.28■■□□□ 1.8
TBC1D9B-201ENST00000355235 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TBC1D9B-201ENST00000355235 APLP2Q06481 763 aa25.51■■□□□ 1.68
TBC1D9B-201ENST00000355235 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.46■■□□□ 1.67
TBC1D9B-201ENST00000355235 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TBC1D9B-201ENST00000355235 TRIM41Q8WV44 630 aa25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9B-201ENST00000355235 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TBC1D9B-201ENST00000355235 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
TBC1D9B-201ENST00000355235 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TBC1D9B-201ENST00000355235 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
TBC1D9B-201ENST00000355235 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TBC1D9B-201ENST00000355235 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TBC1D9B-201ENST00000355235 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
TBC1D9B-201ENST00000355235 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.53■■□□□ 1.52
TBC1D9B-201ENST00000355235 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.49■■□□□ 1.51
TBC1D9B-201ENST00000355235 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TBC1D9B-201ENST00000355235 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TBC1D9B-201ENST00000355235 HRCP23327 699 aa24.17■■□□□ 1.46
TBC1D9B-201ENST00000355235 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TBC1D9B-201ENST00000355235 ITGAEP38570 1179 aa24.07■■□□□ 1.44
TBC1D9B-201ENST00000355235 ABCC9O60706 1549 aa24.05■■□□□ 1.44
TBC1D9B-201ENST00000355235 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TBC1D9B-201ENST00000355235 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
TBC1D9B-201ENST00000355235 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TBC1D9B-201ENST00000355235 NEFLP07196 543 aa23.87■■□□□ 1.41
TBC1D9B-201ENST00000355235 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.84■■□□□ 1.41
TBC1D9B-201ENST00000355235 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.61■■□□□ 1.37
TBC1D9B-201ENST00000355235 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.6■■□□□ 1.37
TBC1D9B-201ENST00000355235 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TBC1D9B-201ENST00000355235 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TBC1D9B-201ENST00000355235 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TBC1D9B-201ENST00000355235 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TBC1D9B-201ENST00000355235 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.28■■□□□ 1.32
TBC1D9B-201ENST00000355235 NEUROD1Q13562 356 aa23.26■■□□□ 1.31
TBC1D9B-201ENST00000355235 TRIM52Q96A61 297 aa23.25■■□□□ 1.31
TBC1D9B-201ENST00000355235 SCRIBQ14160 1630 aa23.16■■□□□ 1.3
TBC1D9B-201ENST00000355235 P3H3Q8IVL6 736 aa23.12■■□□□ 1.29
TBC1D9B-201ENST00000355235 FBLN2P98095 1184 aa23.1■■□□□ 1.29
TBC1D9B-201ENST00000355235 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TBC1D9B-201ENST00000355235 MYT1Q01538 1121 aa22.99■■□□□ 1.27
TBC1D9B-201ENST00000355235 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TBC1D9B-201ENST00000355235 ARID3CA6NKF2 412 aa22.97■■□□□ 1.27
TBC1D9B-201ENST00000355235 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TBC1D9B-201ENST00000355235 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TBC1D9B-201ENST00000355235 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.89■■□□□ 1.25
TBC1D9B-201ENST00000355235 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.87■■□□□ 1.25
TBC1D9B-201ENST00000355235 ANP32CO43423 234 aa22.87■■□□□ 1.25
TBC1D9B-201ENST00000355235 BCANQ96GW7 911 aa22.8■■□□□ 1.24
TBC1D9B-201ENST00000355235 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.77■■□□□ 1.24
TBC1D9B-201ENST00000355235 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TBC1D9B-201ENST00000355235 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.68■■□□□ 1.22
TBC1D9B-201ENST00000355235 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TBC1D9B-201ENST00000355235 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TBC1D9B-201ENST00000355235 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TBC1D9B-201ENST00000355235 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.56■■□□□ 1.2
TBC1D9B-201ENST00000355235 TONSLQ96HA7 1378 aa22.48■■□□□ 1.19
TBC1D9B-201ENST00000355235 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TBC1D9B-201ENST00000355235 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.45■■□□□ 1.18
TBC1D9B-201ENST00000355235 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.45■■□□□ 1.18
TBC1D9B-201ENST00000355235 CLIP1P30622 1438 aa22.43■■□□□ 1.18
TBC1D9B-201ENST00000355235 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TBC1D9B-201ENST00000355235 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9B-201ENST00000355235 NACADO15069 1562 aa22.3■■□□□ 1.16
TBC1D9B-201ENST00000355235 CEP162Q5TB80 1403 aa22.3■■□□□ 1.16
TBC1D9B-201ENST00000355235 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TBC1D9B-201ENST00000355235 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.169e-6■■■■■ 50.1
TBC1D9B-201ENST00000355235 EEA1Q15075 1411 aa22.27■■□□□ 1.16
TBC1D9B-201ENST00000355235 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
TBC1D9B-201ENST00000355235 GOLGA3Q08378 1498 aa22.25■■□□□ 1.15
TBC1D9B-201ENST00000355235 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TBC1D9B-201ENST00000355235 FKBP8Q14318 412 aa22.24■■□□□ 1.15
TBC1D9B-201ENST00000355235 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9B-201ENST00000355235 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9B-201ENST00000355235 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 21.5
TBC1D9B-201ENST00000355235 BCL11AQ9H165 835 aa22.2■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 NEFMP07197 916 aa22.19■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 TSPY4P0CV99 314 aa22.19■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 TSPY10P0CW01 314 aa22.19■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.18■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 MIER1Q8N108 512 aa22.17■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 SLC24A1O60721 1099 aa22.16■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.15■■□□□ 1.14
TBC1D9B-201ENST00000355235 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.13■■□□□ 1.13
TBC1D9B-201ENST00000355235 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.13■■□□□ 1.13
TBC1D9B-201ENST00000355235 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TBC1D9B-201ENST00000355235 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TBC1D9B-201ENST00000355235 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.07■■□□□ 1.12
TBC1D9B-201ENST00000355235 KIF27Q86VH2 1401 aa22.07■■□□□ 1.12
TBC1D9B-201ENST00000355235 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TBC1D9B-201ENST00000355235 TMC1Q8TDI8 760 aa22.05■■□□□ 1.12
TBC1D9B-201ENST00000355235 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.04■■□□□ 1.12
TBC1D9B-201ENST00000355235 MRS2Q9HD23 443 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms