RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528845.5

SIGIRR-216, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-216ENST00000528845 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.79■■■■■ 4.92
SIGIRR-216ENST00000528845 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.66■■■■■ 4.1
SIGIRR-216ENST00000528845 ABCC9O60706 1549 aa40.1■■■■■ 4.01
SIGIRR-216ENST00000528845 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.44■■■■□ 3.74
SIGIRR-216ENST00000528845 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.4■■■■□ 3.74
SIGIRR-216ENST00000528845 NACADO15069 1562 aa38.32■■■■□ 3.73
SIGIRR-216ENST00000528845 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
SIGIRR-216ENST00000528845 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.02■■■■□ 3.68
SIGIRR-216ENST00000528845 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.82■■■■□ 3.64
SIGIRR-216ENST00000528845 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.52■■■■□ 3.6
SIGIRR-216ENST00000528845 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.52■■■■□ 3.6
SIGIRR-216ENST00000528845 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.31■■■■□ 3.56
SIGIRR-216ENST00000528845 SCRIBQ14160 1630 aa37.19■■■■□ 3.54
SIGIRR-216ENST00000528845 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.07■■■■□ 3.52
SIGIRR-216ENST00000528845 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.78■■■■□ 3.48
SIGIRR-216ENST00000528845 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
SIGIRR-216ENST00000528845 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.21■■■■□ 3.39
SIGIRR-216ENST00000528845 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.02■■■■□ 3.36
SIGIRR-216ENST00000528845 SMARCA4P51532 1647 aa35.53■■■■□ 3.28
SIGIRR-216ENST00000528845 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SIGIRR-216ENST00000528845 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.43■■■■□ 3.26
SIGIRR-216ENST00000528845 NCAPD3P42695 1498 aa35.41■■■■□ 3.26
SIGIRR-216ENST00000528845 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.32■■■■□ 3.24
SIGIRR-216ENST00000528845 SMARCA2P51531 1590 aa35.31■■■■□ 3.24
SIGIRR-216ENST00000528845 HMGXB3Q12766 1538 aa35.16■■■■□ 3.22
SIGIRR-216ENST00000528845 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.16■■■■□ 3.22
SIGIRR-216ENST00000528845 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
SIGIRR-216ENST00000528845 WIZO95785 1651 aa34.9■■■■□ 3.18
SIGIRR-216ENST00000528845 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
SIGIRR-216ENST00000528845 NESP48681 1621 aa34.67■■■■□ 3.14
SIGIRR-216ENST00000528845 ERCC6Q03468 1493 aa34.52■■■■□ 3.12
SIGIRR-216ENST00000528845 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
SIGIRR-216ENST00000528845 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.45■■■■□ 3.1
SIGIRR-216ENST00000528845 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.4■■■■□ 3.1
SIGIRR-216ENST00000528845 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.27■■■■□ 3.08
SIGIRR-216ENST00000528845 CUX2O14529 1486 aa34.18■■■■□ 3.06
SIGIRR-216ENST00000528845 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.16■■■■□ 3.06
SIGIRR-216ENST00000528845 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.16■■■■□ 3.06
SIGIRR-216ENST00000528845 CFTRP13569 1480 aa34.14■■■■□ 3.06
SIGIRR-216ENST00000528845 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
SIGIRR-216ENST00000528845 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.99■■■■□ 3.03
SIGIRR-216ENST00000528845 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
SIGIRR-216ENST00000528845 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.93■■■■□ 3.02
SIGIRR-216ENST00000528845 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.92■■■■□ 3.02
SIGIRR-216ENST00000528845 WDR62O43379 1518 aa33.79■■■■□ 3
SIGIRR-216ENST00000528845 PRDM2Q13029 1718 aa33.73■■■□□ 2.99
SIGIRR-216ENST00000528845 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
SIGIRR-216ENST00000528845 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.43■■■□□ 2.94
SIGIRR-216ENST00000528845 TOPBP1Q92547 1522 aa33.43■■■□□ 2.94
SIGIRR-216ENST00000528845 ABCC8Q09428 1581 aa33.36■■■□□ 2.93
SIGIRR-216ENST00000528845 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.33■■■□□ 2.93
SIGIRR-216ENST00000528845 IFT140Q96RY7 1462 aa33.24■■■□□ 2.91
SIGIRR-216ENST00000528845 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
SIGIRR-216ENST00000528845 CUX1P39880 1505 aa33.13■■■□□ 2.89
SIGIRR-216ENST00000528845 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
SIGIRR-216ENST00000528845 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
SIGIRR-216ENST00000528845 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.05■■■□□ 2.88
SIGIRR-216ENST00000528845 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.03■■■□□ 2.88
SIGIRR-216ENST00000528845 SOGA1O94964 1423 aa33.02■■■□□ 2.88
SIGIRR-216ENST00000528845 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.97■■■□□ 2.871e-7■■■■■ 29.9
SIGIRR-216ENST00000528845 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
SIGIRR-216ENST00000528845 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
SIGIRR-216ENST00000528845 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.85■■■□□ 2.85
SIGIRR-216ENST00000528845 OSCARQ8IYS5 282 aa32.83■■■□□ 2.85
SIGIRR-216ENST00000528845 SYNJ1O43426 1573 aa32.78■■■□□ 2.84
SIGIRR-216ENST00000528845 TOP2BQ02880 1626 aa32.75■■■□□ 2.83
SIGIRR-216ENST00000528845 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.73■■■□□ 2.83
SIGIRR-216ENST00000528845 WDR97A6NE52 1622 aa32.69■■■□□ 2.82
SIGIRR-216ENST00000528845 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.68■■■□□ 2.82
SIGIRR-216ENST00000528845 FBLN2P98095 1184 aa32.62■■■□□ 2.81
SIGIRR-216ENST00000528845 GRIN2BQ13224 1484 aa32.61■■■□□ 2.81
SIGIRR-216ENST00000528845 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.61■■■□□ 2.81
SIGIRR-216ENST00000528845 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.61■■■□□ 2.81
SIGIRR-216ENST00000528845 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.54■■■□□ 2.8
SIGIRR-216ENST00000528845 CHD1O14646 1710 aa32.54■■■□□ 2.8
SIGIRR-216ENST00000528845 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
SIGIRR-216ENST00000528845 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
SIGIRR-216ENST00000528845 PBRM1Q86U86 1689 aa32.47■■■□□ 2.79
SIGIRR-216ENST00000528845 SYNJ2O15056 1496 aa32.41■■■□□ 2.78
SIGIRR-216ENST00000528845 TRIM41Q8WV44 630 aa32.3■■■□□ 2.76
SIGIRR-216ENST00000528845 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.26■■■□□ 2.76
SIGIRR-216ENST00000528845 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
SIGIRR-216ENST00000528845 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
SIGIRR-216ENST00000528845 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.26■■■□□ 2.76
SIGIRR-216ENST00000528845 ARHGEF11O15085 1522 aa32.25■■■□□ 2.75
SIGIRR-216ENST00000528845 ADAMTS12P58397 1594 aa32.24■■■□□ 2.75
SIGIRR-216ENST00000528845 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.22■■■□□ 2.75
SIGIRR-216ENST00000528845 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.21■■■□□ 2.75
SIGIRR-216ENST00000528845 GRIN2AQ12879 1464 aa32.19■■■□□ 2.74
SIGIRR-216ENST00000528845 KIF27Q86VH2 1401 aa32.17■■■□□ 2.74
SIGIRR-216ENST00000528845 IGF1RP08069 1367 aa32.13■■■□□ 2.73
SIGIRR-216ENST00000528845 NUP160Q12769 1436 aa32.07■■■□□ 2.72
SIGIRR-216ENST00000528845 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.05■■■□□ 2.72
SIGIRR-216ENST00000528845 CEP170Q5SW79 1584 aa32.05■■■□□ 2.72
SIGIRR-216ENST00000528845 ARAP1Q96P48 1450 aa32■■■□□ 2.71
SIGIRR-216ENST00000528845 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.92■■■□□ 2.7
SIGIRR-216ENST00000528845 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.91■■■□□ 2.7
SIGIRR-216ENST00000528845 CUL7Q14999 1698 aa31.9■■■□□ 2.7
SIGIRR-216ENST00000528845 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.83■■■□□ 2.69
SIGIRR-216ENST00000528845 JPH4Q96JJ6 628 aa31.81■■■□□ 2.68
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