Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOX2Q8IUF8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms