RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.97■■■■■ 5.91
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.41■■■■■ 4.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.11■■■■■ 4.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC9O60706 1549 aa42.79■■■■■ 4.44
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.65■■■■■ 4.42
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.64■■■■■ 4.42
CAPNS1-207ENST00000589146 NACADO15069 1562 aa42.31■■■■■ 4.36
CAPNS1-207ENST00000589146 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.07■■■■■ 4.33
CAPNS1-207ENST00000589146 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.91■■■■■ 4.3
CAPNS1-207ENST00000589146 SCRIBQ14160 1630 aa41.57■■■■■ 4.25
CAPNS1-207ENST00000589146 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.01■■■■■ 4.16
CAPNS1-207ENST00000589146 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.65■■■■■ 4.1
CAPNS1-207ENST00000589146 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
CAPNS1-207ENST00000589146 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPNS1-207ENST00000589146 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
CAPNS1-207ENST00000589146 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
CAPNS1-207ENST00000589146 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
CAPNS1-207ENST00000589146 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCA4P51532 1647 aa39.94■■■■□ 3.99
CAPNS1-207ENST00000589146 WIZO95785 1651 aa39.73■■■■□ 3.95
CAPNS1-207ENST00000589146 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.56■■■■□ 3.92
CAPNS1-207ENST00000589146 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.32■■■■□ 3.89
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCA2P51531 1590 aa39.32■■■■□ 3.88
CAPNS1-207ENST00000589146 NCAPD3P42695 1498 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-207ENST00000589146 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HMGXB3Q12766 1538 aa38.98■■■■□ 3.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.97■■■■□ 3.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.85■■■■□ 3.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.81■■■■□ 3.8
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.27■■■■□ 3.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM41Q8WV44 630 aa38.15■■■■□ 3.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CFTRP13569 1480 aa38.13■■■■□ 3.69
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC8Q09428 1581 aa38.02■■■■□ 3.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDM2Q13029 1718 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-207ENST00000589146 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNJ1O43426 1573 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TOP2BQ02880 1626 aa37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-207ENST00000589146 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.61■■■■□ 3.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NESP48681 1621 aa37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-207ENST00000589146 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CUX1P39880 1505 aa37.51■■■■□ 3.59
CAPNS1-207ENST00000589146 EEA1Q15075 1411 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.38■■■■□ 3.57
CAPNS1-207ENST00000589146 SOGA1O94964 1423 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.25■■■■□ 3.55
CAPNS1-207ENST00000589146 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-207ENST00000589146 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TOPBP1Q92547 1522 aa37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-207ENST00000589146 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-207ENST00000589146 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF27Q86VH2 1401 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-207ENST00000589146 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF21BO75037 1637 aa36.88■■■■□ 3.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CUX2O14529 1486 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA3Q08378 1498 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR62O43379 1518 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PRXQ9BXM0 1461 aa36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR97A6NE52 1622 aa36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ERCC6Q03468 1493 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-207ENST00000589146 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-207ENST00000589146 IGF1RP08069 1367 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-207ENST00000589146 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-207ENST00000589146 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-207ENST00000589146 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-207ENST00000589146 IFT140Q96RY7 1462 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP162Q5TB80 1403 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-207ENST00000589146 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CUL7Q14999 1698 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PBRM1Q86U86 1689 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-207ENST00000589146 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.388e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CLIP1P30622 1438 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIN2BQ13224 1484 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
CAPNS1-207ENST00000589146 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS12P58397 1594 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-207ENST00000589146 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-207ENST00000589146 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-207ENST00000589146 ARAP1Q96P48 1450 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.86■■■■□ 3.33
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