RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378538.7

SPI1-202, Transcript of Spi-1 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPI1, Length 1,403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1-202ENST00000378538 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.46■■■■■ 6.15
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SPI1-202ENST00000378538 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
SPI1-202ENST00000378538 NACADO15069 1562 aa45.27■■■■■ 4.84
SPI1-202ENST00000378538 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.18■■■■■ 4.82
SPI1-202ENST00000378538 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.01■■■■■ 4.8
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SPI1-202ENST00000378538 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.66■■■■■ 4.74
SPI1-202ENST00000378538 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.59■■■■■ 4.73
SPI1-202ENST00000378538 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.31■■■■■ 4.68
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SPI1-202ENST00000378538 SCRIBQ14160 1630 aa43.67■■■■■ 4.58
SPI1-202ENST00000378538 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.59■■■■■ 4.57
SPI1-202ENST00000378538 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.27■■■■■ 4.52
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SPI1-202ENST00000378538 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.13■■■■■ 4.49
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SPI1-202ENST00000378538 SMARCA2P51531 1590 aa41.55■■■■■ 4.24
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SPI1-202ENST00000378538 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.25■■■■■ 4.19
SPI1-202ENST00000378538 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.22■■■■■ 4.19
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SPI1-202ENST00000378538 CUX2O14529 1486 aa41.21■■■■■ 4.19
SPI1-202ENST00000378538 NESP48681 1621 aa41.2■■■■■ 4.19
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SPI1-202ENST00000378538 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.62■■■■■ 4.09
SPI1-202ENST00000378538 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.58■■■■■ 4.09
SPI1-202ENST00000378538 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
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SPI1-202ENST00000378538 WDR62O43379 1518 aa40.16■■■■■ 4.02
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SPI1-202ENST00000378538 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.11■■■■■ 4.01
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SPI1-202ENST00000378538 PRDM2Q13029 1718 aa39.65■■■■□ 3.94
SPI1-202ENST00000378538 TRIM41Q8WV44 630 aa39.43■■■■□ 3.9
SPI1-202ENST00000378538 OSCARQ8IYS5 282 aa39.41■■■■□ 3.9
SPI1-202ENST00000378538 TOPBP1Q92547 1522 aa39.35■■■■□ 3.89
SPI1-202ENST00000378538 IFT140Q96RY7 1462 aa39.31■■■■□ 3.88
SPI1-202ENST00000378538 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
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SPI1-202ENST00000378538 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
SPI1-202ENST00000378538 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.85■■■■□ 3.81
SPI1-202ENST00000378538 SOGA1O94964 1423 aa38.8■■■■□ 3.8
SPI1-202ENST00000378538 CHD1O14646 1710 aa38.74■■■■□ 3.79
SPI1-202ENST00000378538 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
SPI1-202ENST00000378538 ARHGEF11O15085 1522 aa38.73■■■■□ 3.79
SPI1-202ENST00000378538 CUX1P39880 1505 aa38.71■■■■□ 3.79
SPI1-202ENST00000378538 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.71■■■■□ 3.79
SPI1-202ENST00000378538 FBLN2P98095 1184 aa38.7■■■■□ 3.79
SPI1-202ENST00000378538 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
SPI1-202ENST00000378538 WDR97A6NE52 1622 aa38.52■■■■□ 3.76
SPI1-202ENST00000378538 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.52■■■■□ 3.76
SPI1-202ENST00000378538 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.52■■■■□ 3.76
SPI1-202ENST00000378538 GRIN2BQ13224 1484 aa38.42■■■■□ 3.74
SPI1-202ENST00000378538 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
SPI1-202ENST00000378538 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
SPI1-202ENST00000378538 ARAP1Q96P48 1450 aa38.37■■■■□ 3.73
SPI1-202ENST00000378538 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.31■■■■□ 3.72
SPI1-202ENST00000378538 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.3■■■■□ 3.72
SPI1-202ENST00000378538 SYNJ2O15056 1496 aa38.28■■■■□ 3.72
SPI1-202ENST00000378538 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.27■■■■□ 3.72
SPI1-202ENST00000378538 PBRM1Q86U86 1689 aa38.25■■■■□ 3.71
SPI1-202ENST00000378538 SYNJ1O43426 1573 aa38.24■■■■□ 3.71
SPI1-202ENST00000378538 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.19■■■■□ 3.7
SPI1-202ENST00000378538 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.69
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SPI1-202ENST00000378538 ADAMTS12P58397 1594 aa37.89■■■■□ 3.66
SPI1-202ENST00000378538 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.82■■■■□ 3.64
SPI1-202ENST00000378538 NUP160Q12769 1436 aa37.81■■■■□ 3.64
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SPI1-202ENST00000378538 JPH4Q96JJ6 628 aa37.49■■■■□ 3.59
SPI1-202ENST00000378538 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
SPI1-202ENST00000378538 IGF1RP08069 1367 aa37.39■■■■□ 3.58
SPI1-202ENST00000378538 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.35■■■■□ 3.57
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