RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628593.1

SETD9-211, Transcript of SET domain containing 9, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD9, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9-211ENST00000628593 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.75■■■■■ 6.04
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SETD9-211ENST00000628593 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.08■■■■■ 4.65
SETD9-211ENST00000628593 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
SETD9-211ENST00000628593 NACADO15069 1562 aa43.92■■■■■ 4.62
SETD9-211ENST00000628593 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.9■■■■■ 4.62
SETD9-211ENST00000628593 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.73■■■■■ 4.59
SETD9-211ENST00000628593 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.6■■■■■ 4.57
SETD9-211ENST00000628593 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.45
SETD9-211ENST00000628593 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.8■■■■■ 4.44
SETD9-211ENST00000628593 SCRIBQ14160 1630 aa42.7■■■■■ 4.43
SETD9-211ENST00000628593 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.66■■■■■ 4.42
SETD9-211ENST00000628593 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.14■■■■■ 4.34
SETD9-211ENST00000628593 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.95■■■■■ 4.31
SETD9-211ENST00000628593 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
SETD9-211ENST00000628593 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.28■■■■■ 4.2
SETD9-211ENST00000628593 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.17■■■■■ 4.18
SETD9-211ENST00000628593 SMARCA4P51532 1647 aa40.84■■■■■ 4.13
SETD9-211ENST00000628593 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
SETD9-211ENST00000628593 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.69■■■■■ 4.1
SETD9-211ENST00000628593 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.67■■■■■ 4.1
SETD9-211ENST00000628593 NCAPD3P42695 1498 aa40.62■■■■■ 4.09
SETD9-211ENST00000628593 SMARCA2P51531 1590 aa40.52■■■■■ 4.08
SETD9-211ENST00000628593 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.44■■■■■ 4.07
SETD9-211ENST00000628593 HMGXB3Q12766 1538 aa40.35■■■■■ 4.05
SETD9-211ENST00000628593 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
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SETD9-211ENST00000628593 WIZO95785 1651 aa40.18■■■■■ 4.02
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SETD9-211ENST00000628593 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.46■■■■□ 3.91
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SETD9-211ENST00000628593 ERCC6Q03468 1493 aa39.33■■■■□ 3.89
SETD9-211ENST00000628593 CFTRP13569 1480 aa39.24■■■■□ 3.87
SETD9-211ENST00000628593 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.21■■■■□ 3.87
SETD9-211ENST00000628593 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.97■■■■□ 3.83
SETD9-211ENST00000628593 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.97■■■■□ 3.83
SETD9-211ENST00000628593 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
SETD9-211ENST00000628593 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.87■■■■□ 3.81
SETD9-211ENST00000628593 CUX2O14529 1486 aa38.84■■■■□ 3.81
SETD9-211ENST00000628593 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.8■■■■□ 3.8
SETD9-211ENST00000628593 PRDM2Q13029 1718 aa38.66■■■■□ 3.78
SETD9-211ENST00000628593 WDR62O43379 1518 aa38.65■■■■□ 3.78
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SETD9-211ENST00000628593 TOPBP1Q92547 1522 aa38.37■■■■□ 3.73
SETD9-211ENST00000628593 ABCC8Q09428 1581 aa38.29■■■■□ 3.72
SETD9-211ENST00000628593 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.27■■■■□ 3.72
SETD9-211ENST00000628593 CUX1P39880 1505 aa38.15■■■■□ 3.7
SETD9-211ENST00000628593 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
SETD9-211ENST00000628593 IFT140Q96RY7 1462 aa38.07■■■■□ 3.69
SETD9-211ENST00000628593 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.98■■■■□ 3.67
SETD9-211ENST00000628593 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.96■■■■□ 3.67
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SETD9-211ENST00000628593 TOP2BQ02880 1626 aa37.79■■■■□ 3.64
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SETD9-211ENST00000628593 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.74■■■■□ 3.63
SETD9-211ENST00000628593 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
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SETD9-211ENST00000628593 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.61■■■■□ 3.61
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SETD9-211ENST00000628593 WDR97A6NE52 1622 aa37.54■■■■□ 3.6
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SETD9-211ENST00000628593 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.4■■■■□ 3.58
SETD9-211ENST00000628593 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.37■■■■□ 3.57
SETD9-211ENST00000628593 OSCARQ8IYS5 282 aa37.34■■■■□ 3.57
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SETD9-211ENST00000628593 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
SETD9-211ENST00000628593 SYNJ2O15056 1496 aa37.16■■■■□ 3.54
SETD9-211ENST00000628593 KIF27Q86VH2 1401 aa37.13■■■■□ 3.54
SETD9-211ENST00000628593 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.12■■■■□ 3.53
SETD9-211ENST00000628593 CHD1O14646 1710 aa37.11■■■■□ 3.53
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SETD9-211ENST00000628593 ADAMTS12P58397 1594 aa37.03■■■■□ 3.52
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SETD9-211ENST00000628593 PRXQ9BXM0 1461 aa36.51■■■■□ 3.43
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