RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.66■■■■■ 5.86
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GNPTG-201ENST00000204679 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.79■■■■■ 4.44
GNPTG-201ENST00000204679 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.6■■■■■ 4.41
GNPTG-201ENST00000204679 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.59■■■■■ 4.41
GNPTG-201ENST00000204679 ABCC9O60706 1549 aa42.3■■■■■ 4.36
GNPTG-201ENST00000204679 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.95■■■■■ 4.31
GNPTG-201ENST00000204679 NACADO15069 1562 aa41.69■■■■■ 4.26
GNPTG-201ENST00000204679 SCRIBQ14160 1630 aa41.43■■■■■ 4.22
GNPTG-201ENST00000204679 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.29■■■■■ 4.2
GNPTG-201ENST00000204679 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
GNPTG-201ENST00000204679 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.55■■■■■ 4.08
GNPTG-201ENST00000204679 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
GNPTG-201ENST00000204679 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.21■■■■■ 4.03
GNPTG-201ENST00000204679 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.09■■■■■ 4.01
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GNPTG-201ENST00000204679 SMARCA4P51532 1647 aa39.66■■■■□ 3.94
GNPTG-201ENST00000204679 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.44■■■■□ 3.9
GNPTG-201ENST00000204679 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
GNPTG-201ENST00000204679 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.09■■■■□ 3.85
GNPTG-201ENST00000204679 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.93■■■■□ 3.82
GNPTG-201ENST00000204679 SMARCA2P51531 1590 aa38.89■■■■□ 3.82
GNPTG-201ENST00000204679 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.87■■■■□ 3.81
GNPTG-201ENST00000204679 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
GNPTG-201ENST00000204679 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
GNPTG-201ENST00000204679 TRIM41Q8WV44 630 aa38.56■■■■□ 3.76
GNPTG-201ENST00000204679 NCAPD3P42695 1498 aa38.49■■■■□ 3.75
GNPTG-201ENST00000204679 HMGXB3Q12766 1538 aa38.46■■■■□ 3.75
GNPTG-201ENST00000204679 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.23■■■■□ 3.71
GNPTG-201ENST00000204679 ABCC8Q09428 1581 aa38.22■■■■□ 3.71
GNPTG-201ENST00000204679 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.04■■■■□ 3.68
GNPTG-201ENST00000204679 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
GNPTG-201ENST00000204679 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.86■■■■□ 3.659e-6■■■■■ 50.1
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GNPTG-201ENST00000204679 SYNJ1O43426 1573 aa37.72■■■■□ 3.63
GNPTG-201ENST00000204679 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.58■■■■□ 3.61
GNPTG-201ENST00000204679 SOGA1O94964 1423 aa37.56■■■■□ 3.6
GNPTG-201ENST00000204679 PRDM2Q13029 1718 aa37.55■■■■□ 3.6
GNPTG-201ENST00000204679 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.53■■■■□ 3.6
GNPTG-201ENST00000204679 TOP2BQ02880 1626 aa37.49■■■■□ 3.59
GNPTG-201ENST00000204679 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.43■■■■□ 3.58
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GNPTG-201ENST00000204679 EEA1Q15075 1411 aa37.39■■■■□ 3.58
GNPTG-201ENST00000204679 CUX1P39880 1505 aa37.36■■■■□ 3.57
GNPTG-201ENST00000204679 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.31■■■■□ 3.56
GNPTG-201ENST00000204679 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.28■■■■□ 3.56
GNPTG-201ENST00000204679 NESP48681 1621 aa37.25■■■■□ 3.55
GNPTG-201ENST00000204679 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.19■■■■□ 3.54
GNPTG-201ENST00000204679 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.14■■■■□ 3.54
GNPTG-201ENST00000204679 GOLGA3Q08378 1498 aa36.97■■■■□ 3.51
GNPTG-201ENST00000204679 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.94■■■■□ 3.5
GNPTG-201ENST00000204679 KIF21BO75037 1637 aa36.94■■■■□ 3.5
GNPTG-201ENST00000204679 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.9■■■■□ 3.5
GNPTG-201ENST00000204679 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.9■■■■□ 3.5
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GNPTG-201ENST00000204679 KIF27Q86VH2 1401 aa36.86■■■■□ 3.49
GNPTG-201ENST00000204679 TOPBP1Q92547 1522 aa36.82■■■■□ 3.48
GNPTG-201ENST00000204679 CEP162Q5TB80 1403 aa36.79■■■■□ 3.48
GNPTG-201ENST00000204679 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.76■■■■□ 3.48
GNPTG-201ENST00000204679 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.76■■■■□ 3.47
GNPTG-201ENST00000204679 CUX2O14529 1486 aa36.74■■■■□ 3.47
GNPTG-201ENST00000204679 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
GNPTG-201ENST00000204679 PRXQ9BXM0 1461 aa36.68■■■■□ 3.46
GNPTG-201ENST00000204679 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
GNPTG-201ENST00000204679 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.62■■■■□ 3.45
GNPTG-201ENST00000204679 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.62■■■■□ 3.45
GNPTG-201ENST00000204679 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.61■■■■□ 3.45
GNPTG-201ENST00000204679 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.53■■■■□ 3.44
GNPTG-201ENST00000204679 IGF1RP08069 1367 aa36.52■■■■□ 3.44
GNPTG-201ENST00000204679 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
GNPTG-201ENST00000204679 CLIP1P30622 1438 aa36.43■■■■□ 3.42
GNPTG-201ENST00000204679 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.38■■■■□ 3.42
GNPTG-201ENST00000204679 WDR97A6NE52 1622 aa36.38■■■■□ 3.41
GNPTG-201ENST00000204679 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.35■■■■□ 3.41
GNPTG-201ENST00000204679 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
GNPTG-201ENST00000204679 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
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GNPTG-201ENST00000204679 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
GNPTG-201ENST00000204679 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.22■■■■□ 3.39
GNPTG-201ENST00000204679 ERCC6Q03468 1493 aa36.21■■■■□ 3.39
GNPTG-201ENST00000204679 WDR62O43379 1518 aa36.16■■■■□ 3.38
GNPTG-201ENST00000204679 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.16■■■■□ 3.38
GNPTG-201ENST00000204679 CUL7Q14999 1698 aa36.15■■■■□ 3.38
GNPTG-201ENST00000204679 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.12■■■■□ 3.37
GNPTG-201ENST00000204679 ARAP1Q96P48 1450 aa36.02■■■■□ 3.36
GNPTG-201ENST00000204679 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
GNPTG-201ENST00000204679 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
GNPTG-201ENST00000204679 IFT140Q96RY7 1462 aa35.98■■■■□ 3.35
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.96■■■■□ 3.35
GNPTG-201ENST00000204679 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.95■■■■□ 3.35
GNPTG-201ENST00000204679 PBRM1Q86U86 1689 aa35.93■■■■□ 3.34
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
GNPTG-201ENST00000204679 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.84■■■■□ 3.33
GNPTG-201ENST00000204679 APLP2Q06481 763 aa35.82■■■■□ 3.33
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