RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455810.5

PRKCQ-AS1-204, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 920 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.27■■■■■ 6.12
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.54■■■■■ 5.2
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PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.82■■■■■ 4.77
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 NACADO15069 1562 aa44.72■■■■■ 4.75
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.43■■■■■ 4.7
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.41■■■■■ 4.7
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.13■■■■■ 4.65
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.76■■■■■ 4.6
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.47■■■■■ 4.55
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.46■■■■■ 4.55
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SCRIBQ14160 1630 aa43.29■■■■■ 4.52
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.1■■■■■ 4.49
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.96■■■■■ 4.47
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.21■■■■■ 4.35
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.97■■■■■ 4.31
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SMARCA4P51532 1647 aa41.41■■■■■ 4.22
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 NCAPD3P42695 1498 aa41.25■■■■■ 4.19
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.22■■■■■ 4.19
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SMARCA2P51531 1590 aa41.2■■■■■ 4.19
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 HMGXB3Q12766 1538 aa41.08■■■■■ 4.17
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.05■■■■■ 4.16
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.03■■■■■ 4.16
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 WIZO95785 1651 aa40.56■■■■■ 4.08
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 NESP48681 1621 aa40.29■■■■■ 4.04
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ERCC6Q03468 1493 aa40.24■■■■■ 4.03
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.23■■■■■ 4.03
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CADPSQ9ULU8 1353 aa40■■■■□ 3.99
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CUX2O14529 1486 aa39.97■■■■□ 3.99
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.92■■■■□ 3.98
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.84■■■■□ 3.97
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CFTRP13569 1480 aa39.75■■■■□ 3.95
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.64■■■■□ 3.94
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.56■■■■□ 3.92
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.56■■■■□ 3.92
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.56■■■■□ 3.92
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 WDR62O43379 1518 aa39.46■■■■□ 3.91
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 PRDM2Q13029 1718 aa39.45■■■■□ 3.91
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 TOPBP1Q92547 1522 aa38.91■■■■□ 3.82
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.91■■■■□ 3.82
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ABCC8Q09428 1581 aa38.9■■■■□ 3.82
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.87■■■■□ 3.81
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 IFT140Q96RY7 1462 aa38.73■■■■□ 3.79
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
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PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CUX1P39880 1505 aa38.53■■■■□ 3.76
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PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.43■■■■□ 3.74
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.35■■■■□ 3.73
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SOGA1O94964 1423 aa38.35■■■■□ 3.73
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.28■■■■□ 3.727e-7■□□□□ 9
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 WDR97A6NE52 1622 aa38.27■■■■□ 3.72
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.17■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.16■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 TOP2BQ02880 1626 aa38.15■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 OSCARQ8IYS5 282 aa38.14■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SYNJ1O43426 1573 aa38.11■■■■□ 3.69
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.07■■■■□ 3.68
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 GRIN2BQ13224 1484 aa37.98■■■■□ 3.67
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.97■■■■□ 3.67
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.96■■■■□ 3.67
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CHD1O14646 1710 aa37.95■■■■□ 3.67
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.94■■■■□ 3.66
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 PBRM1Q86U86 1689 aa37.9■■■■□ 3.66
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 FBLN2P98095 1184 aa37.79■■■■□ 3.64
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SYNJ2O15056 1496 aa37.77■■■■□ 3.64
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.64■■■■□ 3.62
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.64■■■■□ 3.62
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.64■■■■□ 3.62
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ARHGEF11O15085 1522 aa37.62■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.62■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ADAMTS12P58397 1594 aa37.62■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.6■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.51■■■■□ 3.59
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 GRIN2AQ12879 1464 aa37.51■■■■□ 3.59
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 TRIM41Q8WV44 630 aa37.48■■■■□ 3.59
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 KIF27Q86VH2 1401 aa37.39■■■■□ 3.58
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 NUP160Q12769 1436 aa37.36■■■■□ 3.57
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CEP170Q5SW79 1584 aa37.33■■■■□ 3.57
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ARAP1Q96P48 1450 aa37.3■■■■□ 3.56
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CUL7Q14999 1698 aa37.24■■■■□ 3.55
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 IGF1RP08069 1367 aa37.23■■■■□ 3.55
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 SHROOM2Q13796 1616 aa37.12■■■■□ 3.53
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.09■■■■□ 3.53
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.01■■■■□ 3.51
PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37■■■■□ 3.51
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