Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAB39Q9Y376 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAB39Q9Y376 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAB39Q9Y376 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAB39Q9Y376 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAB39Q9Y376 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAB39Q9Y376 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAB39Q9Y376 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAB39Q9Y376 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAB39Q9Y376 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAB39Q9Y376 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAB39Q9Y376 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAB39Q9Y376 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAB39Q9Y376 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAB39Q9Y376 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAB39Q9Y376 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAB39Q9Y376 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAB39Q9Y376 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAB39Q9Y376 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAB39Q9Y376 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAB39Q9Y376 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAB39Q9Y376 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAB39Q9Y376 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAB39Q9Y376 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAB39Q9Y376 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAB39Q9Y376 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAB39Q9Y376 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAB39Q9Y376 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAB39Q9Y376 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAB39Q9Y376 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAB39Q9Y376 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAB39Q9Y376 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAB39Q9Y376 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms