Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMC3Q9UQE7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMC3Q9UQE7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMC3Q9UQE7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMC3Q9UQE7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMC3Q9UQE7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
SMC3Q9UQE7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMC3Q9UQE7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMC3Q9UQE7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMC3Q9UQE7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC3Q9UQE7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC3Q9UQE7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMC3Q9UQE7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMC3Q9UQE7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMC3Q9UQE7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC3Q9UQE7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC3Q9UQE7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC3Q9UQE7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMC3Q9UQE7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMC3Q9UQE7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMC3Q9UQE7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC3Q9UQE7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC3Q9UQE7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMC3Q9UQE7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMC3Q9UQE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMC3Q9UQE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMC3Q9UQE7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMC3Q9UQE7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMC3Q9UQE7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMC3Q9UQE7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMC3Q9UQE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMC3Q9UQE7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMC3Q9UQE7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMC3Q9UQE7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMC3Q9UQE7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMC3Q9UQE7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMC3Q9UQE7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMC3Q9UQE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
SMC3Q9UQE7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC3Q9UQE7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC3Q9UQE7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC3Q9UQE7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC3Q9UQE7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms