Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLA2G4CQ9UP65 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLA2G4CQ9UP65 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLA2G4CQ9UP65 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PLA2G4CQ9UP65 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLA2G4CQ9UP65 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLA2G4CQ9UP65 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLA2G4CQ9UP65 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLA2G4CQ9UP65 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLA2G4CQ9UP65 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLA2G4CQ9UP65 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLA2G4CQ9UP65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLA2G4CQ9UP65 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLA2G4CQ9UP65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLA2G4CQ9UP65 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLA2G4CQ9UP65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLA2G4CQ9UP65 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLA2G4CQ9UP65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLA2G4CQ9UP65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLA2G4CQ9UP65 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLA2G4CQ9UP65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLA2G4CQ9UP65 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.8 ms