Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNW9

NOVA2, RNA-binding protein Nova-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA2Q9UNW9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOVA2Q9UNW9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOVA2Q9UNW9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOVA2Q9UNW9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOVA2Q9UNW9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOVA2Q9UNW9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOVA2Q9UNW9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOVA2Q9UNW9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOVA2Q9UNW9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOVA2Q9UNW9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NOVA2Q9UNW9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOVA2Q9UNW9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOVA2Q9UNW9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOVA2Q9UNW9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOVA2Q9UNW9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOVA2Q9UNW9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOVA2Q9UNW9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOVA2Q9UNW9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOVA2Q9UNW9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOVA2Q9UNW9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOVA2Q9UNW9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOVA2Q9UNW9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NOVA2Q9UNW9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOVA2Q9UNW9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOVA2Q9UNW9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOVA2Q9UNW9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOVA2Q9UNW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOVA2Q9UNW9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOVA2Q9UNW9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms