Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN67

PCDHB10, Protocadherin beta-10, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB10Q9UN67 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHB10Q9UN67 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB10Q9UN67 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB10Q9UN67 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB10Q9UN67 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB10Q9UN67 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB10Q9UN67 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB10Q9UN67 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB10Q9UN67 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms