Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PADI4Q9UM07 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PADI4Q9UM07 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PADI4Q9UM07 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PADI4Q9UM07 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PADI4Q9UM07 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PADI4Q9UM07 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PADI4Q9UM07 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PADI4Q9UM07 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PADI4Q9UM07 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PADI4Q9UM07 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PADI4Q9UM07 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI4Q9UM07 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PADI4Q9UM07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PADI4Q9UM07 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI4Q9UM07 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PADI4Q9UM07 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PADI4Q9UM07 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PADI4Q9UM07 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 787.2 ms