Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PADI4Q9UM07 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PADI4Q9UM07 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PADI4Q9UM07 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PADI4Q9UM07 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PADI4Q9UM07 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PADI4Q9UM07 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PADI4Q9UM07 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PADI4Q9UM07 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PADI4Q9UM07 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PADI4Q9UM07 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PADI4Q9UM07 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PADI4Q9UM07 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PADI4Q9UM07 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PADI4Q9UM07 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PADI4Q9UM07 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PADI4Q9UM07 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PADI4Q9UM07 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PADI4Q9UM07 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PADI4Q9UM07 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PADI4Q9UM07 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PADI4Q9UM07 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PADI4Q9UM07 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PADI4Q9UM07 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PADI4Q9UM07 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PADI4Q9UM07 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PADI4Q9UM07 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PADI4Q9UM07 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PADI4Q9UM07 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PADI4Q9UM07 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PADI4Q9UM07 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PADI4Q9UM07 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PADI4Q9UM07 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PADI4Q9UM07 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PADI4Q9UM07 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PADI4Q9UM07 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PADI4Q9UM07 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PADI4Q9UM07 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PADI4Q9UM07 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PADI4Q9UM07 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PADI4Q9UM07 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PADI4Q9UM07 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PADI4Q9UM07 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PADI4Q9UM07 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PADI4Q9UM07 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PADI4Q9UM07 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PADI4Q9UM07 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PADI4Q9UM07 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PADI4Q9UM07 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PADI4Q9UM07 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PADI4Q9UM07 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PADI4Q9UM07 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PADI4Q9UM07 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PADI4Q9UM07 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PADI4Q9UM07 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PADI4Q9UM07 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PADI4Q9UM07 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PADI4Q9UM07 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PADI4Q9UM07 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PADI4Q9UM07 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PADI4Q9UM07 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PADI4Q9UM07 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PADI4Q9UM07 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PADI4Q9UM07 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PADI4Q9UM07 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PADI4Q9UM07 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PADI4Q9UM07 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PADI4Q9UM07 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PADI4Q9UM07 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PADI4Q9UM07 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PADI4Q9UM07 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PADI4Q9UM07 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PADI4Q9UM07 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PADI4Q9UM07 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PADI4Q9UM07 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PADI4Q9UM07 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PADI4Q9UM07 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PADI4Q9UM07 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PADI4Q9UM07 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PADI4Q9UM07 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI4Q9UM07 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PADI4Q9UM07 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PADI4Q9UM07 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI4Q9UM07 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PADI4Q9UM07 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI4Q9UM07 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PADI4Q9UM07 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PADI4Q9UM07 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PADI4Q9UM07 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PADI4Q9UM07 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms