Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3Q9UKS6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3Q9UKS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3Q9UKS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3Q9UKS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3Q9UKS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3Q9UKS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3Q9UKS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3Q9UKS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3Q9UKS6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PACSIN3Q9UKS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3Q9UKS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PACSIN3Q9UKS6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACSIN3Q9UKS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACSIN3Q9UKS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3Q9UKS6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3Q9UKS6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3Q9UKS6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3Q9UKS6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACSIN3Q9UKS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3Q9UKS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3Q9UKS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PACSIN3Q9UKS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACSIN3Q9UKS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACSIN3Q9UKS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3Q9UKS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3Q9UKS6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms