Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALCOCO1Q9P1Z2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CALCOCO1Q9P1Z2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALCOCO1Q9P1Z2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALCOCO1Q9P1Z2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALCOCO1Q9P1Z2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALCOCO1Q9P1Z2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALCOCO1Q9P1Z2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALCOCO1Q9P1Z2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALCOCO1Q9P1Z2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms