Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS2Q9NYR9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKIRAS2Q9NYR9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKIRAS2Q9NYR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKIRAS2Q9NYR9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKIRAS2Q9NYR9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS2Q9NYR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms