Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MIS18AQ9NYP9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MIS18AQ9NYP9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MIS18AQ9NYP9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MIS18AQ9NYP9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MIS18AQ9NYP9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MIS18AQ9NYP9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MIS18AQ9NYP9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MIS18AQ9NYP9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MIS18AQ9NYP9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
MIS18AQ9NYP9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
MIS18AQ9NYP9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
MIS18AQ9NYP9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MIS18AQ9NYP9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MIS18AQ9NYP9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MIS18AQ9NYP9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MIS18AQ9NYP9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MIS18AQ9NYP9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MIS18AQ9NYP9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MIS18AQ9NYP9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MIS18AQ9NYP9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MIS18AQ9NYP9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MIS18AQ9NYP9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MIS18AQ9NYP9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MIS18AQ9NYP9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MIS18AQ9NYP9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MIS18AQ9NYP9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MIS18AQ9NYP9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MIS18AQ9NYP9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MIS18AQ9NYP9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MIS18AQ9NYP9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
MIS18AQ9NYP9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
MIS18AQ9NYP9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MIS18AQ9NYP9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MIS18AQ9NYP9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MIS18AQ9NYP9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MIS18AQ9NYP9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
MIS18AQ9NYP9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
MIS18AQ9NYP9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MIS18AQ9NYP9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MIS18AQ9NYP9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
MIS18AQ9NYP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MIS18AQ9NYP9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MIS18AQ9NYP9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MIS18AQ9NYP9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms