Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.91■■■■■ 4.78
MIS18AQ9NYP9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
MIS18AQ9NYP9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
MIS18AQ9NYP9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
MIS18AQ9NYP9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
MIS18AQ9NYP9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
MIS18AQ9NYP9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
MIS18AQ9NYP9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
MIS18AQ9NYP9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
MIS18AQ9NYP9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
MIS18AQ9NYP9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
MIS18AQ9NYP9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
MIS18AQ9NYP9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
MIS18AQ9NYP9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
MIS18AQ9NYP9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
MIS18AQ9NYP9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
MIS18AQ9NYP9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
MIS18AQ9NYP9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
MIS18AQ9NYP9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
MIS18AQ9NYP9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
MIS18AQ9NYP9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
MIS18AQ9NYP9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
MIS18AQ9NYP9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
MIS18AQ9NYP9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
MIS18AQ9NYP9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
MIS18AQ9NYP9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
MIS18AQ9NYP9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
MIS18AQ9NYP9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
MIS18AQ9NYP9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
MIS18AQ9NYP9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
MIS18AQ9NYP9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MIS18AQ9NYP9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MIS18AQ9NYP9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
MIS18AQ9NYP9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
MIS18AQ9NYP9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
MIS18AQ9NYP9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
MIS18AQ9NYP9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
MIS18AQ9NYP9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
MIS18AQ9NYP9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
MIS18AQ9NYP9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
MIS18AQ9NYP9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
MIS18AQ9NYP9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
MIS18AQ9NYP9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
MIS18AQ9NYP9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
MIS18AQ9NYP9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
MIS18AQ9NYP9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MIS18AQ9NYP9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
MIS18AQ9NYP9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
MIS18AQ9NYP9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
MIS18AQ9NYP9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
MIS18AQ9NYP9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
MIS18AQ9NYP9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
MIS18AQ9NYP9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MIS18AQ9NYP9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MIS18AQ9NYP9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MIS18AQ9NYP9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
MIS18AQ9NYP9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
MIS18AQ9NYP9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
MIS18AQ9NYP9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
MIS18AQ9NYP9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
MIS18AQ9NYP9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
MIS18AQ9NYP9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MIS18AQ9NYP9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
MIS18AQ9NYP9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
MIS18AQ9NYP9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MIS18AQ9NYP9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MIS18AQ9NYP9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
MIS18AQ9NYP9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
MIS18AQ9NYP9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
MIS18AQ9NYP9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
MIS18AQ9NYP9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
MIS18AQ9NYP9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
MIS18AQ9NYP9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
MIS18AQ9NYP9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MIS18AQ9NYP9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
MIS18AQ9NYP9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
MIS18AQ9NYP9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
MIS18AQ9NYP9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
MIS18AQ9NYP9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
MIS18AQ9NYP9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
MIS18AQ9NYP9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
MIS18AQ9NYP9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.7
MIS18AQ9NYP9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
MIS18AQ9NYP9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MIS18AQ9NYP9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MIS18AQ9NYP9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MIS18AQ9NYP9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
MIS18AQ9NYP9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
MIS18AQ9NYP9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
MIS18AQ9NYP9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
MIS18AQ9NYP9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
MIS18AQ9NYP9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
MIS18AQ9NYP9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
MIS18AQ9NYP9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
MIS18AQ9NYP9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
MIS18AQ9NYP9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
MIS18AQ9NYP9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
MIS18AQ9NYP9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
MIS18AQ9NYP9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms