Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTP6Q9NYH9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTP6Q9NYH9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTP6Q9NYH9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTP6Q9NYH9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UTP6Q9NYH9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTP6Q9NYH9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UTP6Q9NYH9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UTP6Q9NYH9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UTP6Q9NYH9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UTP6Q9NYH9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UTP6Q9NYH9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UTP6Q9NYH9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UTP6Q9NYH9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTP6Q9NYH9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTP6Q9NYH9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UTP6Q9NYH9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTP6Q9NYH9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTP6Q9NYH9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms