Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDE1Q9NXR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NDE1Q9NXR1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDE1Q9NXR1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDE1Q9NXR1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NDE1Q9NXR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NDE1Q9NXR1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NDE1Q9NXR1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NDE1Q9NXR1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NDE1Q9NXR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NDE1Q9NXR1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NDE1Q9NXR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NDE1Q9NXR1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NDE1Q9NXR1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NDE1Q9NXR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NDE1Q9NXR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDE1Q9NXR1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDE1Q9NXR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDE1Q9NXR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDE1Q9NXR1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDE1Q9NXR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDE1Q9NXR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDE1Q9NXR1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDE1Q9NXR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDE1Q9NXR1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms